Auf Pin2 am ISP-Anschluss gehören noch 5V, um den ISP über das Board mit Strom zu versorgen.
Und für den Quarz würd ich auf jeden Fall die Anschlüsse vorbereiten, du musst ihn ja erst mal noch nicht einlöten. Es wär einfach ärgerlich, wenn man ihn irgendwann doch mla braucht und ein neues Board machen müsste... und wenn man ihn in der flache Gehäusevarinate nimmt, kann man ihn wunderbar unter dem AVR verstecken.
Außerdem wäre es gut, auch noch 5V und GND auf nen paar von den Steckklemmen zu legen, dann kann man die an den Ports angeschlossenen Schaltungen gleich mit Spannung versorgen.