Sind die Werte bei Hell/Dunkel denn stabil genug, dass du sie sauber auseinanderhalten kannst? Dann würd ich mir da keine großen Gedanken machen...

Bei der Messschaltung teilt sich die Akkuspannung auf den Fototransistor und dessen Vorwiderstand auf. Das Teilungsverhältnis ändert sich je nach Lichteinfall. Der Widerstand des FT wird jedoch nicht unendlich klein, sodass der maximal von ADC messbare Wert von 1023 nie erreicht werden kann.