Hmm wenn der Server auf Linux läuft, könntest du ein CGI-Script machen, und das im Browser bedienen.

Das CGI kann doch auf andere Programme zugreifen, die dann eben halt die Übertragung machen.
Oder in PHP, Safemode off, dann kannst du, ich vermute mal mit exec(...) auch irgendwas ausführen auf dem Server.

lg