Den Lötpunkt eines Bauteils legst du beim Erstellen des Bauteils fest. Einfach die entsprechende Bibliothek öffen und editieren.

Wenn du ein Via unter ein Pad schiebst wird er dies beim Design Rule Check anmeckern. Da zwischen Pads und Vias ein Mindestabstand eingehalten werden muss. Außerdem wäre dies eine sehr "unsaubere" Lösung.