Da Deine Zielplattform der Mega32 ist:
Der CodevisionAVR optimiert ein bisschen besser. Der Unterschied fällt aber gering aus (auf avrfreaks gibt IIRC ein paar Benchmarks).

Die Syntak für Speicher (FLASH, EEPROM) und Interrupts ist anders als beim GCC. Falls Du bestimmte Bibliotheken verwenden willst solltest Du das beachten.