Hallo ebb,
Bei einer LED fließt ein Strom von einigen MilliAmpere, ein Eingang benötigt nur wenige MikroAmpere.
Da ein AVR-Ausgang nur bei Low, also bei durchgeschaltetem GND einen Strom von ca. 20 mA liefern kann, kann auch eine LED mit Vorwiderstand nur vom Port nach Plus angeschlossen werden.
Bei einem Eingang ist das anders; mit einem PullUp-Widerstand von 1...10 KiloOhm liefert der AVR-Ausgang bei durchgeschaltetem GND ein Low und bei nicht durchgeschaltetem GND über den PullUp-Widerstand vom Plus ein High. Die wenigen MikroAmpere für einen nachfolgenden Eingang sind vollkommen ausreichend.