Die mechanische Resonanz sollte ja mit der Schrittfrequenz zusammen gehen, nicht mit der umgerechneten Vollschritt-Frequenz.
Hat denn die Motor-Versorgung eine Welligkeit? Die muß grundsätzlich nicht besonders stabilisiert sein, nur erst mal für die Ursachenforschung. Die 50Hz oder 100Hz könnten ja etwas damit zu tun haben.

Übrigens zu der Frage mit dem Stromabfall ab 1kHz. Das ist das grundsätzliche Problem oder die Eigenschaft von Motoren, dass sie bei hoher Drehzahl Spannung induzieren und dann nur noch bei höherer Spannung Strom aufnehmen.

Das entspricht der Leistungsbilanz, dass die Leistung Drehmoment mal Drehzahl, wobei Das Drehmoment dem Strom entspricht, bei höherer Drehzahl nur mit höherer Spannung erbracht werden kann.
Manfred