Der Unterschied ist das Assembler-Programme nicht auf jedem System laufen, sondern natürlich nur auf dem für den der Assembler bestimmt ist.
Jeder Controller oder Prozessor hat einen anderen Befehlssatz, du kämst ja (hoffentlich) auch nicht auf die Idee z.B. Adobe Photoshop auf nem AVR laufen zu lassen, oder?

Also es kommt auf das System an für den der Assembler bestimmt ist z.B. AVR, CC, PC, MAC etc.
Kurz jeder( oder die meisten) Prozessor braucht einen eigenen Assembler.