So schwer ist's auch nicht, das makefile anzupassen.

Öffne das makefile mit Programers Notepad.
Folgende Zeilen sind wichtig:

Hier kommt der Name des µC hin:
Code:
MCU = atmega128
Hier kommt der Name des Projekts rein. Das hex-file heißt dann später MeinProgramm.hex :
Code:
TARGET = MeinProgramm
Hier kommen alle C-Dateien rein, die zum Projekt gehören. In diesem Falle also main.c, config.c und blabla.c. :
Code:
SRC = main.c config.c blabla.c
Das war's dann auch schon.

Gruß,
askazo