Hallo Heinz,
1. man muß wohl die Massen verbinden. Lt. Datenblatt dürfen die Endanschlüsse vom Poti nicht mehr als +5V und nicht weniger als -5V haben (bezogen auf Masse). Probleme kann es geben, wenn deine Zielschaltung gefährliche Spannungen führt. Dann ist deine MC-schaltung und alles was dranhängt auch nicht mehr berührsicher.
2. Relais klingt gut, da gibt es auch keine Masseprobleme, wenn es schnell genug ist und Prellfreiheit kein Thema, dann ist Relais (oder Reed-Relais) wahrscheinlich die beste Wahl. Alternativ gibt es auch elektronische Schalter (z.B. HC 4066). Die sind schnell, prellfrei, haben aber das selbe "Masseproblem" wie dein elktronisches Poti. Es gibt auch "elektronische Relais", sind aber teuer.