Taster gegen Masse ist idr einfacher.
Zum einen hat der AVR schon intern Pullup-Widerstände. Man spart sich damit externe Beschaltung. Das sollte man sowieso beherzigen wenn man mit µC arbeitet. Aber da die meisten Anwendungen für den Hobbiebereich sind interessiert das eh niemanden

Zum anderen hat man Masse auf einer Platine fast überall zur Verfügung.
Die AVR sind ja auch für komerzielle Zwecke gedacht. Und dafür werden kaum Platinen mit Lochstreifen eingesetzt.
Das Layout wird passend zur Schaltung erstellt und eine großflächige Massefläche vorgesehen. Somit ist die Masse für Taster fast überall da.

Das sollte als kleine Anregung dienen und zum Verständnis, warum immer gegen Masse geschaltet wird. Letzteres könnte man noch tiefer ausweiten, aber das sprengt hier den Rahmen.