Was mir dazu einfällt sind PWM-ICs speziell für 3-Farb-Leds. Die Teile gibts u.a. von Maxim und werden für genau den Zweck auch in diversen Industrieprojekten eingesetzt (z.b. im Auto für die neuen multifunktionalen Anzeigesysteme der Lüftung/Klimaanlage - dort ist dann ein Farbverlauf blau-rot für die Temperatur und einer in anderen Farben für z.B. Lüftungsstärke)
Ansteuerung geht über I2C oder SPI.

Edit: hab grade mal nachgeschaut: MAX6964/6965/6966/6967 sind solche...