Hallo,
> ich dachte das ist dafür um den port bei zu großen eingangsspannungen zu schützen?

Er ist dafür da um einen offenen Port auf ein definiertes Potential zu ziehen.
Überspannungsschutz machen die "protection Diodes". Die Dioden lassen sich nicht zu oder abschalten.
Siehe Chapter "I/O Ports - Introduction" im Atmel Datasheet.

Ciao,
Werner