kurz zu den Einstellungen:

unter dem Menue
Options
Programmer
in der Zeile Programmer wird STK 500 ausgewählt
weeiter unten

Serial
Comport eintrag der seriellen Schnittstelle an der der STK 500 steckt
in der Zeile darunter wird der Pfad angegeben
unter dem das Programm Stk500.exe auf der Platte zu finden ist.