DOS ohne bios ist recht schwer, da es BIOS routinen verwendet.
Die boot-routinen verlangen meist ein bios. apropos customized:
kauf dir ein fertiges board mit bios (z.b. PC/104) und bastel dir ne PC/104 ISA steckplatine... dann kannst du sämtliche I/O + extra controller selber draufpacken und über das ISA bus interface ansprechen... ist nicht leicht, aber auch nicht unmöglich und am netz gibt es genug beispiele+tips.

gruss
hl_angel