PWM kannst Du mit einem normalen Messgerät nicht richtig messen, da brauchst Du ein Oszi für. Es ist halt ein gepulstes Signal. Vielleicht misst Du was bei PWM=255, dann ist die Pulsweite nämlich komplett "gefüllt"

Und das mit dem ISP-Stecker ist wohl fast jedem Besitzer von RN-Control schon passiert, habe mir Stecker und Buchse nun farbig markiert. Den ISP-Anschluss / Port macht es (bei mir zumindest) soweit nix aus...