Die CRC-Rechnung erfolgt immer in die selben zwei Byte rein, also auch bei 100 Byte-Messages hast du nur 2 Byte CRC.
BccLo u. Hi werden am Anfang gesetzt, und dann einfach weitergerechnet

EDIT: MUSST du einen Crc-16 nehmen, für diese kleinen Messages reicht doch ein BCC mit 8 Bit genauso ?