Die Ports verwenden unterschiedliche Versorge-Spannung, einige den AVCC, andere die digitale VCC, ich geh mal davon aus daß das alls korrekt beschaltet ist.
Somit hast du unterschiedliche Charakteristika an den beiden Sorten von Ports.
Zudem sollte an Port C keine Pins geschaltet werden, während eine Wandlung im Gange ist.