Ich habe leider keine Ahnung von WinAVR. Aber bist du sicher, dass die Slashes in deinen Pfadangaben richtig sind?
#Additional libraries.
LIBDIR = C:/Entwicklungsumgebung/DevSoftware/SDKs/WinAVR/avr/lib C:/Entwicklungsumgebung/DevSoftware/SDKs/WinAVR/lib C:/Entwicklungsumgebung/DevSoftware/SDKs/WinAVR/avrlib
Windows steht bei Pfadangaben eigentlich mehr auf auf Backslashes.