Es wird nichts kaputt gehen, auch ohne diese Kondensatoren.

Wenn Du ohnehin noch welche besorgen mußt, (leider), dann setze eben später die vorgesehehen Werte ein. Sie sind sicher auch im Wert unkritisch.
C6 sehe ich auch als recht beliebig an,
C7 soll über 1MOhm schnell aufgeladen werden können, den eher nicht zu groß machen.

C2 glättet die Spannung für den IR Empfänger und unterstützt C8. (unkritisch)
C3 glättet die Spannung nahe beim Motor Treiber. (unkritisch)
C4 soll mit R11 den Prozessor Resset um ein paar µs verzögern, der sollte die 100nF schon besser haben.
C5 glättet die Spannung beim Controller. (unkritisch)
Manfred