Axo, hab nu auch deinen Post verstanden. Also du meinst, direkt nach dem Befehl cpi, wenn dort die Interrupt-Routine aufgerufen wird? Nun hab ich das dann so geändert, bin mir aber nicht sicher, ob das so richtig ist. Die LED blinkt aber immer noch im 1 Sekundentakt.
Code:
.include "m8def.inc"

.equ time = 256-90			;Damit wird der Timer vorgeladen
.equ LED = PB2				;LED an B.2
.def tmp = r16				;Mein Universallregister
.def statusreg = r17      ;Mein Statusregister
.def zaehler = r18			;Mein Zählregister

.org 0x000
	rjmp reset				;Interruptvektor "reset:"

.org OVF0addr
	rjmp pruefZaehler		;Interruptvektor für Timer0 Überlauf, hier springt
							;das Programm hin, wenn der Timer überläuft

reset:
	;Stack einrichten
	ldi tmp, HIGH(RAMEND)		;HIGH-Byte der obersten RAM-Adresse
	out SPH, tmp
	ldi tmp, LOW(RAMEND)		;LOW-Byte der obersten RAM-Adresse
	out SPL, tmp

	sbi DDRB, LED				;B.2 als Ausgang
	cbi PORTB, LED				;B.2 auf LOW stellen -> LED aus am Anfang

	;Timer Register werden belegt, hier Timer 0
	ldi tmp, (1<<CS02) | (1<<CS00)	;prescaler ist 1024
	out TCCR0, tmp					;Register TCCR0 ist für den Prescaller zuständig
	ldi tmp, (1<<TOIE0)				;Hier werden Interrupts nach Timer0 Überlauf eingeschaltet
	out TIMSK, tmp					;Register TIMSK ist dafür zuständig
	ldi tmp, time					;Hier wird der Timmer vorgelaen und zwar mit 255-90
	out TCNT0, tmp					;Er läuft 90 mal durch, bevor ein Interrupt auftritt
	sei								;Interrupts zulassen

loop:
                in statusreg, SREG      ;SREG sichern
	cpi zaehler, 0b00101000		;Wenn Zählregister = 14 ist
	breq zeitum					;dann spring zu "zeitum:"

	rjmp loop					;Immer wieder selbst aufrufen -> Endlosschleife

zeitum:
	clr zaehler					;Zählregister auf 0 setzen
	sbic PINB, LED				;überspringe, wenn B.2 = 0 ist (LED aus?)
	rjmp zeitum1				;wenn B.2 = 1, dann spring zu "zeitum1:"

zeitum0:
	sbi PORTB, LED				;B.2 = 1 setzen -> LED an
	rjmp loop					;wieder zur loop springen

zeitum1:
	cbi PORTB, LED				;B.2 auf 0 setzen -> LED aus
	rjmp loop					;wieder zur loop springen

pruefZaehler:
               	inc zaehler					;Zählregister um 1 erhöhen
	ldi tmp, time				;Hier wird der Timer vorgelaen und zwar mit 255-90
	out TCNT0, tmp				;Er läuft 90 mal durch, bevor ein Interrupt auftritt
                out SREG, statusreg      SREG wiederholen
	reti						;wieder zurück, wo du hergekommen bist
Gruß
Thomas