Genau, zu fragen ist eine gute Idee, bevor man sich selbst gedanken machen muss :P

Willst du den kompletten Code für die Stopuhr haben oder nur den Teil der zählt?
Wenn alles, musst du auch sagen ob du doch eine 7-Segment-Anzeige nimmst oder was anderes. Und ob eine mit gemeinsammer Anode oder Kathode. Und was für einen AVR du verwendest, usw...

Sollen nur die Sekunden oder auch 1/100 Sek gezählt werden?
Du musst doch nur eine Timer einstellen und in der ISR eine Variable hochzählen lassen.
Für den Timer gibt es im Downloadbereich ein gutes Programm, was alles nötige ausrechnet und auch gleich einen Code für Bascom erzeugt.

Da ich nicht weiss wie fit du in Sachen AVR bist ist es schwer dir zu helfen. Was genau willst du denn wissen?
Hast du dir schon gedanken drüber gemacht das die Zeit auch mal wieder auf 0 gesetzt werden muss usw...?