Also ich muss den ATMega in Bascom nur einmal über das Menü Options-Compiler-Chip einstellen, wenn ich dann "Program" oder "Manual Program" auswähle ist er voreingestellt.

ABER, wenn ich die Stromversorgung vom Controller abstelle und dann "Program" oder "Manual Program" auswähle muss ich den Controler manuel angeben.
ICh vermute mal, Bascom versucht den Chip jedesmal wenn man "Program" bzw. "Manual Program" auswählt automatisch zu erkennen. Wenn der Controler dann aber ohne Stromversorgung ist, kann Bascom ihn nicht automatisch erkennen, weil er ja irgendwie nicht "antworten" kann. Folglich wählt Bascom eine default-Einstellung und die passt dann halt nicht.